17 февраля считается датой возрождения деятельности современных студенческих отрядов. В этот день в 2004 году в Москве на Всероссийском Форуме, посвященном 45-летию студенческого стройотрядовского движения, было учреждено молодежное общероссийское общественное движение «Российские Студенческие Отряды». РСО фактически является правопреемниками Всесоюзных студенческих строительных отрядов, которые существовали с 1959 по 1991 год.

Первый студенческий отряд появился в Вологодском молочном институте  в 1967 году. Бойцы были задействованы на электрификации колхозов области. В последующие годы количество линейных отрядов и студентов, работавших в них, постоянно возрастало. Пик расцвета стройотрядовское движение в ВМИ достигло в начале 80-х годов, когда более 1700 студентов трудилось в составе студенческих отрядов. Всего за время существования стройотрядовского движения школу трудового воспитания прошли более 10 000 студентов ВМИ.

Современная история студенческих отрядов в Вологодской ГМХА начинается в 2007 году, когда на работу в Краснодарский край были отправлены 3 студенческих отряда, численностью по 25 человек. В 2008 на базе академии при содействии Вологодского регионального отделения «Российских студенческих отрядов» был создан Штаб СО ВГМХА.

В 2017 году Штаб СО Вологодской ГМХА был переименован и сейчас носит имя Ю.В. Лукинского, первого зонального командира ВМИ. С этого же года академия стала организатором Межрегионального студенческого сельскохозяйственного отряда «Альтаир».

В академии постоянно действует 20 отрядов, из которых 13 - сельскохозяйственных, 1 - финансовый, 2 - специализированных, 1 - строительный, 2 отряда оказания шефской помощи и 1 поисково-спасательный отряд. Численность бойцов – 594 человек. Это самое многочисленное трудовое движение в Вологодской области.

Ежегодно Вологодская ГМХА признается одним из лучших вузов Минсельхоза РФ, организующих работу студенческих отрядов. По итогам 2020 года академия заняла второе место в главной номинации «Лучшее высшее учебное заведение, организующее работу студенческих отрядов» Всероссийского конкурса специализированных студенческих отрядов высших учебных заведений Минсельхоза РФ, разделив его со Ставропольским государственным аграрным университетом. До этого на протяжении четырех лет академия удерживала 3 место.