Большую часть Вологодской области занимают леса. Потребность в специалистах с высшим лесным образованием на предприятиях лесного комплекса очень высока.
В период перестройки и перехода к рыночной экономике приход молодых специалистов резко сократился, и возникла острая нехватка кадров. В связи с этим в 1996 году на базе агрономического факультета ВГМХА по инициативе и с участием начальника управления лесного хозяйства Н.Н. Неволина была открыта специальность «Лесное хозяйство» с целью подготовки специалистов для лесной отрасли Европейского Севера России.
В 1997 году произведен первый набор студентов по очной и заочной формам обучения. В 1998 году организована кафедра лесного хозяйства, а факультет получил название «Агрономии и лесного хозяйства».
Осенью в 1999 году заложен первый в Вологодской области Дендрологический сад площадью 12,5 га. Цель создания дендросада: сохранение, изучение и обогащение генофонда древесных растений природной и культурной флоры, рационального использования растительных ресурсов, проведения научно-исследовательской и культурно-просветительской работы в области ботаники и охраны растительного мира.
С 2012 года входит в состав «Совета ботанических садов России». Его постоянная коллекция насчитывает около 260 видов деревьев и кустарников местной и интродуцированной флоры. Представлены породы Европейской части России, Дальнего Востока, Сибири, Северной Америки и других регионов. В настоящее время дендрологический сад является учебным, научно-исследовательским и культурно-просветительским центром. Ведется активная работа по созданию базового городского питомника, в котором будет выращиваться крупномерный посадочный материал для озеленения.
В 2013 году на факультете агрономии и лесного хозяйства открыто новое направление подготовки: «Технология лесозаготовительных и деревоперерабатывающих производств» по профилю «Лесоинженерное дело». Предпосылками открытия явилась острая нехватка профильных специалистов на лесозаготовительных и деревоперерабатывающих предприятий лесного комплекса Вологодской области. Первый выпуск состоялся в 2017 году.
В 2018 году кафедра лесного хозяйства отпраздновала свой юбилей – 20 лет. Были приглашены ветераны, преподаватели, выпускники и друзья кафедры.
С 2020 года на факультете агрономии и лесного хозяйства открыто направление по подготовке специалистов среднего звена «Охотоведение и звероводство», с 2025 года обучение проводится по направлению «Лесное и лесопарковое хозяйство».
Заведующие кафедрой
Первым заведующим кафедрой был избран кандидат с.-х. наук, доцент О.А. Конюшатов,
с 2005 года – кандидат с.-х. наук, доцент С.А. Корчагов,
с 2007 года – кандидат с.-х. наук, доцент Дружинин Ф.Н.,
с 2014 года - кандидат с.-х. наук, доцент С.Е. Грибов,
с 2016 года и по настоящее время - доктор с.-х. наук, профессор Ф.Н. Дружинин.